cron.daily とかの実行

/etc/crontab
もしくは、
/etc/anacron
に設定され、実行されるようだ。

なお、手元のCentOS 5.3の環境はちょっと変な設定になっていて、/etc/anacron に設定されていると思いきや、anacron は定期実行されておらず、 /etc/crontab に直接 runparts が設定されていて、そちらで実行されているようだった。おそらく、RHEL5と6でのやり方の違いをそのまま受け継いているのだろう。

参考
http://d.hatena.ne.jp/enakai00/20111004/1317718773